El problema con vibraciones es de balanceo y no de alineación. También le revisaron el balanceo de las ruedas?
También podría ser un neumático deformado, con alguna tela cortada, esto hace que se forme un huevo (pequeño o grande según la rotura) y vibra desde cierta velocidad.
Otra posibilidad que se me ocurre, aunque más trágica es un problema con el cardan o el diferencial, que esté mal balanceado o con algún defecto de fabricación. Hacelo revisar bien, ya que está en garantía y no es normal creo yo.
Saludos