Cualquier motor admite recitificado y montaje de pistones sobremedida, dentro de cierto margen claro. Esos dos motores son con mucha probabilidad el mismo con la diferencia de cilindrada. Yo comprobaría las referencias de ambos motores de las principales piezas mecánicas que no tienen que ver con la culata y pistones y que fueran susceptibles de ser diferentes por la diferencia de potencia (bielas, cigueñal, casquillos, cojinetes, bimasa, embrague, caja de cambios,...) Si las referencias son las mismas, seguro que el rectificado no afectará negativamente.